MagRob CL usuwa zanieczyszczenia biologiczne za pomocą wody pod wysokim ciśnieniem. Zebrane zanieczyszczenia odprowadzane są do zbiornika i poddane wielostopniowej  filtracji z wykorzystaniem filtra automatycznego. Czyszczenie burt może odbywać się w basenie portowym – zarówno nad i pod linią wody – do 10m – bez obawy przed uwolnieniem do niego zebranych zanieczyszczeń. System filtrujący zwraca wodę użytą do czyszczenia w stanie niezagrażającym lokalnej florze i faunie. Czyszczenie odbywa się w czasie załadunku/rozładunku jednostki, co wpływa znacząco na czas wykonywanych prac. 

Pojazd jest zdalnie sterowany i posiada system pozycjonowania, dzięki czemu nie wymaga asysty nurka.